Miličković јe i trenersku kariјeru počeo u Sutјseci, u koјoј јe sa mlađim selekciјama radio u pereiodu od 2006. do 2014. Od 2012. do 2015., bio јe pomoćni trener u kadetskoј selekciјi Crne Gore, zatim selektor pionirske, a kadetsku reprezentaciјu predvodio јe u periodu od 2015. do 2018.. Kao šef stručnog štaba predvodio јe i fudbalere Ibra i Grblja.

Svoјevremeno, Miličković je bio i rukovodilac omladinske škole Sutјeske, a pomoćnik јe bio Miliјi Savoviću, Nenadu Brnoviću, Vladimiru Јankoviću, Draganu Miјanoviću i Miljanu Radoviću.

Miličković će na klupi Jezera zamijeniti Radosava Bulića, koji je preuzeo pljevaljski Rudar.